østersøen snæbel kellersee
snæblen eller helt, blev der benyttet en chip, der oprinde-
ligt var tiltænkt atlantisk laks (cgrasP)
13
. selv om chippen
er udviklet til en anden art, kan den alligevel godt benyttes
med succes, hvis bare arterne er nært beslægtede, som til-
fældet med snæbel, helt og laks. andre studier har ligeledes
benyttet samme chip til andre heltfisk med gode resultater
14
.
cgrasP chippen indeholder i alt omkring 32.000 gener,
der undersøges samtidigt.
af de 32.000 gener, der var tilgængelige på den anvend-
te dna chip, udviste 6993 gener et signifikant signal, når
baggrundsstøjen var filtreret fra. at alle gener på chippen
ikke giver et resultat er almindeligt og skyldes især geners
variable udtryk i forskellige væv og, at chippen som nævnt
er udviklet til den atlantiske laks. lignende studier har da
også gjort samme observation
15
. af de 6993 gener var 674
gener statistisk signifikant forskelligt udtrykt i de tre popu-
lationer. dette svarer til 9,6 % af de undersøgte gener. når
man kigger nærmere på parvise forskelle imellem popula-
tionerne var 76 gener forskelligt udtrykt mellem snæbel og
helt fra kellersee og 212 gener forskelligt udtrykt mellem
snæbel og helt fra østersøen (figur 3). Hvert individs gene-
tiske profil kan holdes op mod andre individers profil, og
man kan derved konstruere en form for stamtræ, en såkaldt
hierarchical clustering
, der grupperer individerne. denne
analyse (figur 4) grupperede entydigt alle snæbler sammen
i en gruppe, helt fra østersøen i en anden gruppe og helt fra
kellersee i en tredje gruppe. analysen reflekterer med andre
ord det forhold, at de tre populationer er genetisk forskel-
lige, og individer inden for en population ligner hinanden
mere, end de ligner individer fra en anden population. man
taler om, at populationerne er genetisk differentierede.
snæblen adskiller sig altså i aktiviteten af en række ge-
ner fra andre heltfisk. Her skal vi huske på, at målingerne
af genekspression er foretaget på fisk, der er holdt under
nøjagtigt samme miljø, og de registrerede forskelle skyldes
derfor udelukkende genetiske forskelle og kan ikke henføres
til miljøeffekter. Potentielt kunne alle de observerede gener
derfor være resultatet af naturlig selektion, der har formet
snæblen til et liv i de sydvestjyske vandløb. men hvilke pro-
Figur 4: Gruppering af de undersøgte individer baseret på gen-
ekspression. Individerne grupperer entydigt efter den population,
de tilhører. Ligeledes grupperer gentagne målinger fra samme
individ sammen.
Figur 3: Antallet af forskelligt udtrykte gener mellem de tre popu-
lationer. I alt 212 gener var forskelligt udtrykt mellem helt fra
Østersøen og snæbel, 76 gener forskelligt udtrykt mellem snæbel
og helt fra Kellersee og endeligt var 369 gener forskelligt udtrykt
mellem helt fra Østersøen og helt fra Kellersee.
Antal signifikante gener (p = 0.01)
anova
østersøen
vs. snæbel
østersøen
vs. kellersee
snæbel
vs. kellersee
109